Sistema fisiologico di separazione fra circolazione sanguigna e liquido cefalorachidiano, è una membrana selettiva che regola gli scambi fra sangue, encefalo e liquor permettendo il passaggio di alcune sostanze ma non di altre. La barriera ematoencefàlica controlla costantemente che nel sistema nervoso centrale vengano introdotti i metaboliti necessari e rimosse le sostanze dannose. È costituita dai capillari cerebrali, dai plessi corioidei e dall'aracnoide. Diverse condizioni patologiche e alcune sostanze possono alterare la normale funzionalità della barriera ematoencefalica, quali ischemia, stato ipertensivo acuto, crisi convulsive, meningiti, etc.